A R 1100 GS foi uma motocicleta de uso misto, sendo equipada com motor flat-twin (boxer) de 1.085 cc. Além disso, o modelo foi o primeiro da família GS a usar arrefecimento a ar e refrigeração a óleo, em vez dos motores airhead anteriores, usados em motocicletas BMW desde as R 32. Entre as opções da moto estavam os punhos aquecidos e sistema ABS. Em 1999 a R 1100 GS foi substituída pela R 1150 GS.